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Identificação de organismo, o que é isso?

Identificação de organismo, o que é isso?


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Estou tentando descobrir o que é isso, veja a imagem abaixo.

Estou pensando que estes são alguns ovos de inseto ou algum tipo de planta parecida com musgo.
A substância está presa a um pilar de aço, do lado de fora, cerca de 5 pés acima do solo.
A substância é encontrada na Holanda em uma área de prado úmido.

A substância tem várias células minúsculas ou ovos, parece ter apenas 1 camada de espessura e tem uma sensação suave / macia.

Desculpe pela imagem ruim, minha câmera não focalizava melhor por causa da superfície reflexiva do pilar.


O que temos aqui parecem ser ovos de insetos agrupados, e exemplos como esse tendem a ter algum tipo de mariposa ou borboleta como culpada. Parece semelhante a ovos de mariposa que observei em superfícies. Veja esta página com informações e esta página com um exemplo que se parece vagamente com a sua fotografia. Você precisaria de um especialista para identificar uma espécie específica, se possível.


É mais provável que sejam ovos de caracóis. Se estiver em uma área úmida ou muito úmida, e os ovos parecem estar imersos em uma matriz de uma substância transparente, que ajuda a reter água. Os insetos não botam seus ovos em substâncias como essa, pois são mais resistentes à dessecação.


Se obtiver uma resolução mais alta e uma imagem mais próxima, seria um pouco mais fácil, mas pelo que percebi, tenho duas sugestões. Para mim, parecem ser pequenos ovos amarelos agrupados, o que me leva a crer que pode ser um inseto da serralha ou um inseto da senhora.

Os ovos do inseto da serralha se parecem com:

Os ovos de uma joaninha se parecem com:

Como essas fotos são de qualidade muito superior, é fácil distinguir os ovos e eles têm altura. Se eu encontrar mais opções viáveis, irei publicá-las.


Identificação microbiana

9.7 Conclusão

Este capítulo descreveu algumas das técnicas de identificação microbiana realizadas. As técnicas descritas foram divididas entre métodos fenotípicos e genotípicos. É importante notar que os agrupamentos estabelecidos por sistemas fenéticos e filogenéticos nem sempre coincidem e, dentro de cada agrupamento, as diferenças metodológicas e os conteúdos variáveis ​​de diferentes bancos de dados às vezes levam a análises conflitantes.

Além disso, é importante entender que quaisquer sistemas usados ​​para identificar bactérias, sejam fenotípicas ou genotípicas, terão limitações, porque nenhuma metodologia de teste individual fornecerá resultados 100% precisos.

Em termos de seleção entre os métodos, isso vai depender de custos e recursos, do tempo que o microbiologista está preparado para esperar e do nível de identificação necessário. Alguns microbiologistas acreditam que a única maneira de caracterizar um microrganismo corretamente é por meio de uma “abordagem polifásica”, que é uma combinação de métodos de teste fenotípico e métodos de teste genotípico. No entanto, isso consome muito tempo e é proibitivamente caro para os laboratórios padrão. A maioria dos laboratórios de teste de rotina seleciona kits de teste fenotípico e usa instalações de teste de contrato estabelecidas onde o teste genotípico é necessário.

O que é importante, ao fazer uma seleção, é voltar ao básico e considerar: para que serve a identificação? o que o microbiologista precisa saber? e o que o resultado diz ao microbiologista? Essas perguntas podem ajudar na seleção e implementação do teste de identificação microbiana apropriado.


Identificação de bactérias: 7 etapas

Os pontos a seguir destacam as sete etapas para identificação de bactérias isoladas de uma amostra. As etapas são: 1. Morfologia e coloração 2. Características culturais 3. Reações bioquímicas 4. Caracteres antigênicos 5. Tipagem de bactérias: sensibilidade a bacteriófagos 6. Cidade de patógenos animais 7. Sensibilidade a antibióticos.

Identificação de bactérias: Etapa # 1. Morfologia e coloração:

Servir como critério preliminar. O esfregaço com coloração de Gram mostra a reação de Gram, tamanho, forma, agrupamentos das bactérias e posição intracelular do endosporo. A reação de coloração especial pode revelar a presença de cápsula.

A preparação de gotas suspensas pode ser usada para estudar a motilidade das bactérias. Um filme úmido não corado é examinado sob um microscópio de iluminação de solo escuro para observar a morfologia exata do delicado espiroqueta. Um esfregaço é corado pelo método Ziehl Neelsen para demonstrar a reação de coloração ácido-resistente.

Identificação de bactérias: Etapa # 2. Características culturais:

A necessidade de crescimento e o aparecimento de colônias na mídia a olho nu são outros critérios para auxiliar na identificação de bactérias. Uma cultura é o crescimento de uma bactéria em meio nutriente artificial ou meio de cultura preparado em laboratório.

São feitas tentativas para cultivar (para cultivar ou cultivar) as bactérias em meios de diferentes composições (glicose, mistura de sais inorgânicos, extrato de carne ou infusão de carne com sangue) incubados sob uma variedade de condições (diferentes temperaturas, pH) na presença de gases atmosféricos oxigênio (aerobicamente).

A capacidade ou incapacidade de crescer em meio contendo um inibidor seletivo (por exemplo, sal biliar, optoquina, telurita, bacitracina, verde malaquita, pH baixo, pH alto) também pode ser útil para identificar a bactéria.

O crescimento de bactérias em meio de cultura líquido (por exemplo, caldo nutritivo) pode mostrar:

(2) Pequeno depósito na parte inferior

(3) Crescimento superficial (formação de películas). (Fig. 7.1a).

O aparecimento de massas discretas de crescimento ou colônias que podem ser cultivadas a partir de bactérias isoladas na superfície do meio sólido (ágar nutriente) pode ser usado para estudar o tamanho das colônias (diâmetro em mm), seu contorno (seja circular, inteira, recortada ou ondulada ou rizóide), sua elevação (convexa baixa, convexa alta, plana, semelhante a um platô, umbonato ou nodular) —Fig. 7.1b), sua transparência (límpida e transparente) ou opaca, sejam incolores (brancas ou pigmentadas) ou se produzam qualquer alteração no meio (por exemplo, hemólise no meio de ágar sangue).

Identificação de bactérias: Etapa # 3. Reações bioquímicas:

Por exemplo. fermentação de vários açúcares (carboidratos). A morfologia e os caracteres culturais podem não ser capazes de distinguir algumas espécies de bactérias, mas essas mesmas espécies podem exibir diferenças distintas nas suas reações bioquímicas, e. bacilos tifóide e paratifóide (a glicose e o manitol são fermentados sem produção de gás pelos bacilos tifóides, enquanto os bacilos paratifóides produzem ácido e gás).

Certos serotipos do grupo das salmonelas podem ser semelhantes entre si nas propriedades de fermentação.

O crescimento da bactéria em meio líquido fermenta açúcares particulares (glicose, lactose, manitol) com a produção de ácido, que é detectado pela mudança de cor do corante indicador Andrade & # 8217s incorporado no meio onde a produção de gás é detectada pelo coleção de bolha de ar em um pequeno tubo invertido (tubo Durham & # 8217s) imerso no meio.

Outros testes são usados ​​para descobrir a capacidade de uma bactéria para produzir produtos finais específicos, por exemplo, Indol, sulfureto de hidrogênio, nitrito e certas enzimas (oxidase, catalase, urease, gelatinase, colagenase, lecitinase, lipase) em meios de cultura.

Identificação de bactérias: Etapa # 4. Caráteres antigênicos:

Espécies ou tipos de bactérias podem ser facilmente e distintamente identificados por & # 8220específico& # 8221 reações de anticorpos observadas em testes sorológicos realizados em uma lâmina de vidro. Este anticorpo específico (anti-soro) é obtido a partir do animal (coelho) imunizado contra um tipo particular de microrganismos que se aglutina com o mesmo anti-soro.

Uma bactéria desconhecida pode, portanto, ser identificada pela demonstração de sua reação com um dentre vários anti-soros padrão conhecidos.

Da mesma forma, o soro de uma pessoa que sofre de uma infecção bacteriana pode conter anticorpos específicos. A natureza da infecção pode, assim, ser diagnosticada pela demonstração de que o soro do paciente & # 8217s aglutina um de uma série de antígenos conhecidos de culturas de laboratório, por ex. Teste widal na febre tifóide.

Identificação de bactérias: Etapa # 5. Tipagem de bactérias: sensibilidade a bacteriófagos:

Uma única espécie bacteriana patogênica pode incluir diferentes tipos de cepas que são distinguíveis em caracteres menores. O reconhecimento do tipo de cepa isolada de um paciente pode ser de grande importância em estudos epidemiológicos relacionados à origem e à disseminação da infecção na comunidade.

A tipagem das manchas pode ser feita por testes bioquímicos ou sorológicos especiais. Outro método importante de tipagem consiste em testar a suscetibilidade da cultura à lise por cada um de um conjunto de bacteriófagos líticos de tipo específico.

Identificação de bactérias: Etapa # 6. Cidade de Patógenos Animais:

A identificação final de uma cepa toxigênica do bacilo do tétano pode ser feita pela injeção da toxina liberada pelo bacilo do tétano na base da cauda de dois camundongos, um deles já protegido por injeção prévia de antissoro específico à toxina do tétano (um veneno solúvel proteína secretada pelos bacilos do tétano).

O camundongo desprotegido apresenta sintomas de tétano, enquanto o camundongo protegido sem nenhum sintoma de tétano identifica a cultura, como um organismo produtor de toxina, como o anti-soro injetado neutralizou a toxina liberada pelos bacilos do tétano. Da mesma forma, o bacilo da difteria também é identificado por inflamação e necrose da pele da cobaia provocada pela exotoxina diftérica.

Identificação de bactérias: Etapa # 7. Sensibilidade a antibióticos:

O organismo é testado quanto à sua capacidade de crescer em meios nutritivos artificiais contendo diferentes antibióticos e agentes quimioterápicos em diferentes concentrações. No teste de difusão em disco, a cultura a ser examinada é inoculada confluentemente com zaragatoas sobre a superfície de uma placa de ágar e seis a dez discos de papel contendo diferentes antibióticos são colocados em diferentes áreas da placa.

O antibiótico se difunde de cada disco para o ágar circundante. Na incubação, as bactérias crescem em áreas da placa, exceto aquelas ao redor dos discos de antibióticos aos quais são sensíveis. A largura de cada crescimento livre & # 8220zona de inibição& # 8221 é uma medida do grau de sensibilidade do medicamento.

As informações sobre os padrões de sensibilidade das cepas (antibiogramas) isoladas do paciente são necessárias como um guia para o medicamento de escolha para a terapia e também podem ser usadas como um marcador epidemiológico no rastreamento de infecções cruzadas em hospitais.


Identificação da planta: caracteres e métodos

Neste artigo, discutiremos sobre caracteres e métodos de identificação de plantas.

Caracteres considerados antes da identificação da planta:

eu. Se uma planta é herbácea ou lenhosa e anual ou perene por natureza.

ii. Se seiva leitosa ou colorida está ou não presente na folha, caule ou outras partes da planta.

iii. O tipo de folha, filotaxia e venação.

4. Presença ou ausência e tipo de estípula nos rebentos.

v. A distribuição e os tipos de coberturas de superfície (ou seja, cabelos, tricomas, espinhos, etc.).

vi. As partes da flor e o número de sépalas e pétalas, separadas ou fundidas, e também sua disposição, isto é, estivação.

vii. Se o perianto está presente em uma ou mais séries, ou ausente.

viii. Se pappus (por exemplo, Asteraceae) ou epicalyx (por exemplo, Malvaceae) ou estruturas semelhantes estão presentes.

ix. Se um disco secretor de néctar está presente nas flores (por exemplo, Rutaceae).

x. Se as flores são actinomórficas ou zigomórficas.

XI. O número e fixação dos estames e se há fusão de anteras ou filamentos.

xii. O número de pistilos, estilos e estigmas do gineceu, observação de uma seção transversal do ovário, o número de lóculos, o número de óvulos por lóculo e também a placentação.

xiii. Posição do ovário e fusão do perianto, observando-se um corte longitudinal de toda a flor através de seu centro.

Métodos de identificação de plantas:

Os métodos de identificação incluem o seguinte:

(a) Determinação do especialista:

O melhor método de identificação é a determinação especializada em termos de confiabilidade ou precisão. Em geral, os especialistas prepararam tratamentos (monografias, revisões, sinopses) do grupo em questão, e é provável que as floras ou manuais mais recentes incluam os conceitos de táxons dos especialistas.

Os especialistas são normalmente encontrados em jardins botânicos, herbários, museus, faculdades, universidades, etc. No entanto, embora seja de grande confiabilidade, este método apresenta problemas de exigir o valioso tempo dos especialistas e criar atrasos para a identificação.

Ele se aproxima da determinação de especialistas em confiabilidade. Isso se baseia em uma vasta experiência anterior do identificador com o grupo de plantas em questão. Em alguns grupos, isso é virtualmente impossível.

Um terceiro método é a comparação de um desconhecido com espécimes nomeados, fotografias, ilustrações ou descrições. Embora este seja um método confiável, pode ser muito demorado ou virtualmente impossível devido à falta de materiais adequados para comparação. A confiabilidade é, obviamente, dependente da precisão e autenticidade dos espécimes, ilustrações ou descrições usadas na comparação.

(d) O uso de chaves e dispositivos semelhantes (sinopses, esboços, etc.):

Este é de longe o método mais amplamente usado e não requer tempo, materiais ou experiência envolvidos na comparação e reconhecimento.


Exemplo de um artigo de laboratório desconhecido sobre microbiologia | Laboratório de bactérias desconhecidas

O estudo da microbiologia requer não apenas uma compreensão acadêmica do mundo microscópico, mas também uma compreensão prática de técnicas e procedimentos de laboratório usados ​​para identificar, controlar e manipular microrganismos. A identificação adequada de um microrganismo não é importante apenas em um laboratório de microbiologia, mas também nas áreas médica, industrial e farmacêutica. Neste relatório de laboratório, as técnicas e procedimentos de laboratório aprendidos durante este curso foram realizados para avaliar o conhecimento prático de cada aluno em microbiologia.

O objetivo deste relatório de laboratório é 1) demonstrar a compreensão dos métodos e técnicas de laboratório aprendidas durante o semestre 2) explicar os testes realizados em cada incógnita isolada que levaram à identificação de cada uma das incógnitas 3) e fornecer uma base sobre o características, patogenicidade e alguns usos de uma das incógnitas identificadas.


Materiais e métodos

No início deste projeto, o professor entregou a cada aluno um tubo de ensaio numerado contendo duas bactérias desconhecidas (uma Gram positiva e uma Gram negativa). O tubo de ensaio usado neste estudo foi o tubo 109. O instrutor pediu que cada aluno isolasse as duas bactérias desconhecidas e, em seguida, identificasse cada uma. As técnicas e procedimentos de laboratório usados ​​ao longo deste experimento foram do manual de laboratório do McDonald's (4).

Para começar, as duas bactérias desconhecidas tiveram que ser isoladas com sucesso. Usando uma alça de arame, uma pequena amostra do tubo de ensaio numerado foi semeada em um ágar nutriente usando o método de quadrante (4). O tubo de ensaio numerado foi então colocado em um refrigerador para retardar qualquer crescimento contínuo. O ágar nutriente foi rotulado como “Isolamento 1” e colocado em uma incubadora por 48 horas a 37 graus Celsius. Após 48 horas, a placa de isolamento 1 foi observada. Havia 34 colônias isoladas presentes, todas apresentando o mesmo padrão de crescimento. Quatro foram escolhidos aleatoriamente e as colorações de Gram foram realizadas em cada um (o procedimento para a coloração de Gram foi usado de acordo com o manual de laboratório do McDonald's). Cada uma das quatro colorações de Gram mostrou bastonetes positivos. Visto que nenhuma coloração de Gram negativa foi observada, uma abordagem diferente foi feita. Em vez disso, uma pequena amostra do tubo de ensaio numerado foi semeada usando o método de isolamento de quadrante em uma placa de EMB (azul de eosina-metileno) e, em seguida, em uma placa de MSA (ágar de sal de manitol) (4). A placa EMB inibe as bactérias Gram positivas e a placa MSA inibe as bactérias Gram negativas (4). Portanto, o crescimento em cada placa deve favorecer apenas uma das incógnitas. A placa EMB foi identificada como “EMB 1” e a placa MSA foi identificada como “MSA 1.” Cada um foi colocado na incubadora por 48 horas a 37 graus Celsius. Após 48 horas, cada placa foi observada. O EMB 1 teve muito pouco crescimento, por isso foi devolvido à incubadora e deixado crescer por mais 48 horas. MSA 1 teve um supercrescimento significativo e foi descartado. Uma nova placa MSA, denominada MSA 2, foi criada usando o mesmo método de faixa de isolamento de quadrante. Foi deixado incubar por 24 horas a 37 graus Celsius em vez de 48 horas. Após 24 horas, foi observado MSA 2. Teve muitas colônias bem isoladas. Uma das colônias foi transferida para outra placa MSA, denominada MSA 3, usando a faixa de isolamento de quadrante. (Isso foi realizado para garantir que as bactérias Gram positivas estivessem bem isoladas das Gram negativas.) O MSA 3 foi colocado na incubadora a 37 graus Celsius por 24 horas. Após outras 24 horas, ambos MSA 3 e EMB 1 foram observados. Ambos EMB 1 e MSA 3 tinham colônias bem isoladas. Uma das colônias da placa MSA 3 foi corada de Gram. Ele mostrou bastonetes Gram-positivos. Uma alça cheia de bactérias dessa mesma colônia de MSA 3 foi transferida para uma placa de ágar nutriente rotulada como "estoque positivo de NA". Esta placa de ágar nutriente tornou-se a placa de estoque para bactérias Gram positivas para o resto do experimento. Uma das colônias bem isoladas na placa EMB 1 foi transferida para uma nova placa EMB, rotulada EMB 2, usando o método de quadrante de isolamento de estrias. (Isso foi para garantir que as bactérias Gram negativas estivessem bem isoladas das Gram positivas na placa.) Tanto a placa EMB 2 quanto a placa de estoque positiva NA foram colocadas na incubadora a 37 graus Celsius. Após 72 horas, uma das colônias bem isoladas em EMB 2 foi corada por Gram. Foram observados bastonetes Gram negativos. Uma alça cheia de bactérias dessa mesma colônia foi transferida para uma nova placa de ágar nutriente e rotulada como “estoque negativo de NA”. Foi colocado na incubadora a 37 graus Celsius. Neste ponto, ambas as bactérias foram isoladas com sucesso e semeadas em placas de ágar nutriente.

Vários testes foram conduzidos em cada uma das culturas bacterianas desconhecidas. Uma explicação de cada teste e os resultados estão na Tabela 1 (para as bactérias Gram positivas) e na Tabela 2 (para as bactérias Gram negativas). Os testes foram realizados de forma que cada teste eliminasse um possível candidato desconhecido. O Quadro 1 detalha a sequência dos testes realizados nas bactérias Gram positivas e o Quadro 2 detalha a sequência dos testes realizados nas bactérias Gram negativas.

Para as bactérias gram positivas, foram realizados os seguintes testes:

Para as bactérias gram negativas, os seguintes testes foram realizados:

*Todos os testes foram realizados e explicados conforme descrito no Manual do Laboratório McDonald

Tabela 1. Resultados de Gram positivos desconhecidos

TESTE REAGENTES ou MÍDIA OBSERVAÇÕES RESULTADOS INTERPRETAÇÕES
Gram Stain Violeta de cristal, iodo de Gram, álcool, safranina Varinhas Roxas Bastonetes Gram positivos
Uréia Tubo de uréia Nenhuma mudança de cor permaneceu amarela Negativo A bactéria Gram positiva é incapaz de produzir urease, que hidrolisa a ureia em dióxido de carbono e amônia
Catalase Peróxido de hidrogênio Borbulhante Positivo A bactéria Gram positiva possui a enzima catalase, que decompõe o peróxido de hidrogênio em gás oxigênio e água
Caseína Ágar Leite Sem limpeza em torno de bactérias Negativo A bactéria Gram positiva é incapaz de produzir casease, que degrada a proteína caseína do leite
Vermelho de metila Tubos MR-VP, corante vermelho de metila Depois de adicionar vermelho de metila ao tubo de ensaio, a cor mudou de amarelo claro para um amarelo mais escuro sem vermelho Negativo A bactéria Gram positiva não produz ácido durante o catabolismo da glicose
Glicerol Tubo de glicerol Após a inoculação e incubação, o tubo permaneceu vermelho Negativo A bactéria Gram positiva não fermenta o glicerol
Citrato Ágar Simmons Citrate Agar mudou de cor de verde para azul Positivo A bactéria Gram positiva produz a enzima citrase, que decompõe o citrato

Tabela 2. Resultados para Gram negativo desconhecido

TESTE REAGENTES ou MÍDIA OBSERVAÇÕES RESULTADOS INTERPRETAÇÕES
Mancha de Gram Violeta de cristal, iodo de Gram, álcool, safranina Pink Rods Bastonetes Gram negativos
Nitrato Tubos de caldo de nitrato, reagente de nitrato A, reagente de nitrato B, zinco alimentado Após a adição dos reagentes A e B, a cor era vermelho escuro Positivo Bactérias Gram negativas podem reduzir nitrato a nitrito
Citrato Ágar Simmons Citrate Agar mudou de cor de verde para azul Positivo A bactéria Gram negativa produz a enzima citrase, que decompõe o citrato
Uréia Tubo de uréia Nenhuma mudança de cor permaneceu amarela Negativo A bactéria Gram negativa é incapaz de produzir urease, que hidrolisa a ureia em dióxido de carbono e amônia
Caseína Ágar Leite Limpando em torno da linha bacteriana Positivo A bactéria Gram negativa é capaz de produzir casease
Voges-Proskauer (VP) Tubos MR-VP, reagente VP A, reagente VP B Após a adição dos reagentes A e B, o tubo ficou amarelo Negativo A bactéria Gram negativa não produz acetoína como produto final da fermentação da glicose
Sorbitol Tubo de sorbitol Mudança de cor de vermelho para amarelo Positivo Bactérias Gram negativas fermentam o sorbitol


Discussão / Conclusão

O Gram positivo desconhecido foi identificado como Bacillus subtilis. O instrutor verificou que isso estava correto. Essa dedução foi alcançada com várias evidências. Em primeiro lugar, o desconhecido Gram positivo era a forma de bastonete. Isso reduziu para ambos os Bacilo espécies. No entanto, o pesquisador sentiu que era importante realizar uma bateria de testes para concluir com segurança que o Gram positivo desconhecido era de fato B. subtilis. Portanto, a sequência pré-construída de testes ainda era realizada como se todas as cinco opções de Gram positivos ainda fossem possíveis. Em segundo lugar, a série de testes realizados no desconhecido Gram positivo levou a B. subtilis como o único candidato possível. Um teste de uréia negativo removido S. epidermidis como uma possibilidade. Um teste de catalase positivo removido E. faecalis como uma possibilidade. Um teste de caseína negativo removido S. aureus como uma possibilidade. E, um teste de vermelho de metila negativo removido B. cereus como uma possibilidade. Isso deixou apenas B. subtilis. O teste de citrato e o teste de glicerol foram feitos para garantir a precisão da identificação de B. subtilis como o desconhecido Gram positivo. O teste do citrato deu positivo e o teste do glicerol foi negativo. Ambos os testes concordaram com os resultados esperados de B. subtilis metabolismo.

O Gram negativo desconhecido foi identificado como Pseudomonas aeruginosa. O instrutor verificou que isso estava correto. Essa dedução foi alcançada por alguns motivos. Em primeiro lugar, cada um dos testes da série descartou um possível candidato até P. aeruginosa era a única possibilidade que restava. Um teste de nitrato negativo descartado E. coli. Um teste de citrato positivo descartado P. vulgaris (e reforçou a decisão de que E. coli não era o desconhecido). Um teste de uréia negativo removido K. pneumoniae (e reforçou a decisão de que P. vulgaris não era o desconhecido). Um teste de caseína negativo descartado E. aerogenes como uma possibilidade. Isso deixou apenas P. aeruginosa como o desconhecido. Um teste de VP e um teste de sorbitol foram realizados para validar que P. aeruginosa era o desconhecido. Um teste de VP negativo e um teste de sorbitol positivo coincidiram com os resultados esperados de P. aeruginosa metabolismo.

Nenhum problema difícil ocorreu com a identificação de B. subtilis. O único pequeno problema era que B. subtilis cresceu extremamente rápido e o crescimento excessivo era um problema comum. Por exemplo, uma placa de estoque de ágar nutriente para B. subtilis foi inoculado quase diariamente para garantir que as culturas usadas para cada um dos testes de identificação eram jovens.

O desconhecido Gram negativo, no entanto, era muito difícil de identificar. Em primeiro lugar, todas as possibilidades desconhecidas de Gram negativos eram bastonetes. Isso tornou a coloração de Gram inútil na identificação P. aeruginosa com base na forma. Em segundo lugar, a cultura foi muito difícil de isolar porque cresceu extremamente lentamente nas placas EMB e uma cultura pura levou duas semanas para ser alcançada. Em terceiro lugar, vários dos testes tiveram que ser repetidos porque a primeira placa de estoque de P. aeruginosa foi considerado contaminado. Todos os testes tiveram que ser jogados fora e repetidos usando uma placa de estoque recém crescida de P. aeruginosa. Após uma segunda rodada de testes, todos os resultados corresponderam aos resultados esperados de P. aeruginosa exceto para o teste de VP. Resultou positivo. Foi realizada pela terceira vez e o resultado foi negativo. O segundo teste de VP provavelmente estava contaminado e não era um resultado de teste confiável.

Informações básicas sobre Bacillus subtilis

Bacillus subtilis é um micróbio muito bem estudado. É considerada a espécie “tipo” do gênero Bacillus (2). B. subtilis, da família Bacillaceae, foi nomeado em 1872 por Ferdinand Cohn (3). Essa bactéria também é conhecida pelos nomes de bacilo do feno ou bacilo da grama (1). Como outras bactérias no Bacillaceae família, B. subtilis pode crescer na presença de oxigênio (com a ajuda de sua enzima catalase) e é formadora de endosporos (1). Prevê-se que passe a maior parte do tempo inativo e na forma de esporos. B. subtilis é comumente recuperado do solo, água, ar e material vegetal em decomposição (1). Diferentes cepas de B. subtilis podem ser usadas como agentes de controle biológico em diferentes situações. Uma das cepas de B. subtilis produz uma substância química chamada iturina (1). Este produto químico atua como um inibidor de crescimento para muitas outras bactérias e alguns fungos, o que permite que B. subtilis supere vários outros microrganismos que vivem no solo (1). Por causa do efeito inibitório desta cepa em muitas outras bactérias, às vezes é adicionado ao fertilizante para ajudar as plantas delicadas a crescer (1). Além disso, algumas empresas de probióticos estão usando B. subtilis em seus probióticos por causa de seu efeito inibitório em muitas bactérias entéricas patogênicas (2). Algumas pesquisas, no entanto, questionam se é sensato colocar uma bactéria produtora de endosporo no intestino de um ser humano, mesmo que atualmente não seja patogênica para humanos. Contrariamente a isso, estudos descobriram que B. subtilis às vezes habita naturalmente o trato intestinal de humanos sem causar qualquer dano (2). Como está atualmente, acredita-se que B. subtilis não seja patogênico para humanos. Algumas outras aplicações comerciais de B. subtilis incluem: agentes de limpeza em detergentes, processamento de couro, preparação de pratos japoneses e coreanos especiais, modificação de amido e vários outros produtos químicos especializados (3).


Identificação de cromossomos

O isolamento e a observação microscópica dos cromossomos constituem a base da citogenética e é o principal método pelo qual os médicos detectam anormalidades cromossômicas em humanos. Um cariótipo é o número e a aparência dos cromossomos. Para obter uma visão de um cariótipo individual de & rsquos, os citologistas fotografam os cromossomos e, em seguida, recortam e colam cada cromossomo em um gráfico, ou cariograma, também conhecido como ideograma.

Em uma determinada espécie, os cromossomos podem ser identificados por seu número, tamanho, posição do centrômero e padrão de bandas. Em um cariótipo humano, os autossomos ou cromossomos & ldquobody & rdquo (todos os cromossomos não & ndashsex) são geralmente organizados em ordem aproximada de tamanho do maior (cromossomo 1) ao menor (cromossomo 22). No entanto, o cromossomo 21 é na verdade mais curto do que o cromossomo 22. Isso foi descoberto após a denominação da síndrome de Down como trissomia do cromossomo 21, refletindo como essa doença resulta da posse de um cromossomo 21 extra (três no total). Não querendo mudar o nome dessa importante doença, o cromossomo 21 manteve sua numeração, apesar de descrever o menor conjunto de cromossomos. Os cromossomos X e Y não são autossomos e são chamados de cromossomos sexuais.

O cromossomo & ldquoarms & rdquo que se projeta de qualquer extremidade do centrômero pode ser designado como curto ou longo, dependendo de seus comprimentos relativos. O braço curto é abreviado p (para & ldquopetite & rdquo), enquanto o braço longo é abreviado q (porque segue & ldquop & rdquo em ordem alfabética). Cada braço é subdividido e denotado por um número. Usando este sistema de nomenclatura, as localizações nos cromossomos podem ser descritas de forma consistente na literatura científica.

Embora Mendel seja referido como o "pai da genética moderna", ele realizou seus experimentos com nenhuma das ferramentas que os geneticistas de hoje empregam rotineiramente. Uma dessas técnicas citológicas poderosas é o cariótipo, um método no qual traços caracterizados por anormalidades cromossômicas podem ser identificados a partir de uma única célula. Para observar o cariótipo de um indivíduo, as células de uma pessoa (como as células brancas do sangue) são primeiro coletadas de uma amostra de sangue ou outro tecido. No laboratório, as células isoladas são estimuladas a começar a se dividir ativamente. Uma substância química chamada colchicina é então aplicada às células para prender os cromossomos condensados ​​em metáfase. As células são então feitas para inchar usando uma solução hipotônica para que os cromossomos se espalhem. Por fim, a amostra é preservada em um fixador e aplicada em uma lâmina.

O geneticista então cora os cromossomos com um dos vários corantes para visualizar melhor os padrões de bandas distintos e reproduzíveis de cada par de cromossomos. Após a coloração, os cromossomos são visualizados usando microscopia de campo claro. Uma escolha de corante comum é a corante Giemsa. A coloração de Giemsa resulta em aproximadamente 400 & ndash800 bandas (de DNA fortemente enrolado e proteínas condensadas) dispostas ao longo de todos os 23 pares de cromossomos. Um geneticista experiente pode identificar cada cromossomo com base em seu padrão de bandas característico. Além dos padrões de bandas, os cromossomos são identificados com base no tamanho e na localização do centrômero. Para obter a representação clássica do cariótipo em que pares homólogos de cromossomos são alinhados em ordem numérica do mais longo para o mais curto, o geneticista obtém uma imagem digital, identifica cada cromossomo e organiza manualmente os cromossomos nesse padrão.

Figura ( PageIndex <1> ): Um cariótipo humano: Este cariótipo é de um homem. Observe que os cromossomos homólogos têm o mesmo tamanho e as mesmas posições de centrômero e padrões de bandas. Uma fêmea humana teria um par de cromossomos XX em vez do par XY mostrado.

Em sua forma mais básica, o cariótipo pode revelar anormalidades genéticas nas quais um indivíduo tem muitos ou poucos cromossomos por célula. Exemplos disso são a Síndrome de Down, que é identificada por uma terceira cópia do cromossomo 21, e a Síndrome de Turner, que é caracterizada pela presença de apenas um cromossomo X nas mulheres em vez dos dois normais. Os geneticistas também podem identificar grandes deleções ou inserções de DNA. Por exemplo, a Síndrome de Jacobsen, que envolve características faciais distintas, bem como defeitos cardíacos e hemorrágicos, é identificada por uma deleção no cromossomo 11. Finalmente, o cariótipo pode localizar translocações, que ocorrem quando um segmento de material genético se quebra de um cromossomo e se reconecta para outro cromossomo ou para uma parte diferente do mesmo cromossomo. As translocações estão implicadas em certos tipos de câncer, incluindo a leucemia mielóide crônica.

Durante a vida de Mendel & rsquos, a herança era um conceito abstrato que só poderia ser inferido fazendo cruzamentos e observando as características expressas pelos descendentes. Ao observar um cariótipo, os geneticistas de hoje podem realmente visualizar a composição cromossômica de um indivíduo para confirmar ou prever anormalidades genéticas na prole, mesmo antes do nascimento.


Folha de trabalho do laboratório de identificação bacteriana (Laboratório 4)

Por favor, não edite isso nas equipes! Baixe uma cópia para o seu computador para preencher! INTRODUÇÃO Acesse https://www.biointeractive.org/classroom-resources/bacterial-identification-virtual-lab. Responda às seguintes questões nos espaços fornecidos.

Aprenda sobre a ciência e as técnicas usadas para identificar diferentes tipos de bactérias com base em sua sequência de DNA.

Prepare a sample from patient and isolate whole bacterial DNA. Make many copies of the desired piece of DNA. Sequence the DNA. Analyze the sequence and identify the bacteria.

  1. What is &quot16S rDNA,&quot and how is it used to identify species of bacteria? The piece of DNA used for identifying bacteria is the region that codes for a small subunit of the rRNA.

Click to Enter the Lab. (Click the window on the left-hand side of the screen to enter the lab.) As you enter the lab, follow the instructions in the lab (left-hand window). Using the information in the Notebook window on the right, answer the following questions.

PART 1: SAMPLE PREPARATION 4. As the pathology lab technician, what is your task in this virtual lab? Your task is to identify a bacterial sample received from a clinician.

Extracting DNA involves which initial step? Picking up a single colony and drop it into a microcentrifuge tube.

What is the wire ring used for? For scooping up bacteria.

Why are the proteolytic enzymes necessary? To lyse the bacteria cell wall.

Why do you then need to inactivate the proteolytic enzymes and how do you do it? Because we need to introduce a new enzyme. The proteolytic can be denatured by heating the sample in a water bath at 100°C.

After removing the enzymes, why do you spin the sample in the centrifuge? To separate the DNA from other cellular debris.

uma. What is the pellet? Cellular debris b. What is the supernatant? Liquid suspended above the pellet c. Where is the DNA? In the supernatant

PART 2: PCR AMPLIFICATION

Go on to Part 2 and work through the PCR steps. Be sure to read the information in the notebook, including “What is PCR?” 11. What does “PCR” stand for and what is the purpose of PCR? Polymerase Chain Reaction. Use for multiplying DNA copies.

  1. Summarize the process of PCR in a diagram. Include all the steps, labeled and in the right order. (If you are completing this handout online, draw the diagram on a piece of paper, take a photo, save the image as a PDF, and upload it in the space below.)

Add the Master Mix and answer the following questions: 13. What does the Master Mix contain? Water, a buffer, large quantities of the ATCG, large quantities of oligonucleotide DNA primers, and a heat-stable DNA polymerase.

What are primers? Why is a primer added? To bind to the 16S rDNA region to initiate the replication process.

Once the primers bind, what occurs next? The DNA polymerase attaches to it and begin adding ATCG in the 3’ to 5’ direction.

What does &quothighly conserved&quot mean? Part of genes that are extremely similar in related species.

Why are highly conserved regions important in this lab? So that the primers bind to the highly conserved regions of genes so that they can be used to copy DNA from a variety of species of bacteria.

What does &quothighly variable&quot mean? Section of genome that adapt to each bacteria environment. Changing as the bacteria needs changes.

Why are highly variable regions important in this lab? For identifying bacteria.

What is missing in the negative control tube? Sample DNA.

What is present in the positive control tube that is not in the negative control tube? Positive control DNA.

Now run the PCR. Be sure to watch the virtual lab animation before proceeding to the questions.

List each step of a PCR cycle, the temperature, and the duration (time). uma.  Melt: 95°C 30 seconds b. Anneal: 60°C 30 seconds c. Extend: 72°C 45 seconds

Describe what happens during each of the steps in one or two sentences. uma. Separate each strand for the DNA by breaking the hydrogen bonds. b. Allowing the primer to attach to each strand. c. Allowing DNA polymerase to elongate each strand.

After eight cycles, how many copies of the desired DNA have been synthesized? 256 copies.

After 30 cycles? Approximately 1 million copies.

PART 3: PCR PURIFICATION

Approximately how long is the 16s rDNA (bp)? 1500 base pairs.

Why would it be useful to run an electrophoresis gel at this point?

The purpose of the second PCR is not to create identical copies like the first PCR you ran. What is the purpose of this PCR? To produce many copies of variable length,

Where do scientists obtain primers to be used in PCR and in this technique? Commercial source.

Watch the virtual lab animation before proceeding to Part 5.

PART 5: DNA SEQUENCING 34. What is the final PCR product, the stuff contained in your 12 tubes? A mix of DNA pieces of variable length.

What is the purpose of gel electrophoresis? To separate molecules based on differences in size.

How do DNA molecules move in relation to charge? Porque? Because the DNA molecules are negatively charge, they would move through the tube toward the positively charged syringe end.

What is the purpose of the laser beam in determining a DNA sequence? Collect the information from the tubes by light refraction.

Be sure to watch the virtual lab animation before proceeding to Part 6.

PART 6: DNA SEQUENCE ANALYSIS Click on &quotLearn about the science behind sequence matching.&quot 38. What is the ultimate goal of the sequence matching analysis? To determine whether the new sequence bears a significant degree of similarity (or homology) to another known sequence.

The state of having the same or similar relation, relative position, or structure.

What is BLAST and how is it used? Basic Local Alignment Search Tool offer a good combination of speed, sensitivity flexibility, and statistical rigorousness for matching rDNA sequence.

What’s a major assumption when drawing evolutionary relationships between organisms based on DNA sequences? The number of positions that differ in the nucleotide sequence is proportional to the time elapsed since the two species formed their own lines of descent from a common predecessor.

Click to go back to Part 6 and click on &quotLearn more about BLAST search results.&quot 42. Explain what the &quotScore (bits)&quot means on an actual BLAST search result. Measure of information. Two for each matching pair. The higher the score, the better is the match.

Click to go back to Part 6 and proceed through the instructions in the right-hand notebook window. ● Hints: &quotCtrl A&quot will select all the data in the pop-up window, &quotCtrl C&quot will copy it, and &quotCtrl V&quot will paste it into the NCBI website (large yellow box at the top of the BLAST search page). ● Follow the steps listed on the page and be patient. BLAST data can take a while to search. ● When the BLAST results appear, scroll down below the color key to the significant alignments, and then go back to the virtual lab window (left) and follow the instructions.

What is the scientific name of the bacterium you sequenced? Bartonella henselae

Write a brief description of this bacterium in the space provided.

escape to the bloodstream and the lymphatic system. Symptoms include fever, nausea, abdominal pain, and diarrhea. Nowadays, uncooked eggs are a particularly common source of salmonellosis. Soft-boiled eggs, incompletely cooked yolk in fried eggs, or use of raw or incompletely cooked eggs in sauces and desserts can all present a risk.


Historical background

Microbiology essentially began with the development of the microscope. Although others may have seen microbes before him, it was Antonie van Leeuwenhoek, a Dutch draper whose hobby was lens grinding and making microscopes, who was the first to provide proper documentation of his observations. His descriptions and drawings included protozoans from the guts of animals and bacteria from teeth scrapings. His records were excellent because he produced magnifying lenses of exceptional quality. Leeuwenhoek conveyed his findings in a series of letters to the British Royal Society during the mid-1670s. Although his observations stimulated much interest, no one made a serious attempt either to repeat or to extend them. Leeuwenhoek’s “animalcules,” as he called them, thus remained mere oddities of nature to the scientists of his day, and enthusiasm for the study of microbes grew slowly. It was only later, during the 18th-century revival of a long-standing controversy about whether life could develop out of nonliving material, that the significance of microorganisms in the scheme of nature and in the health and welfare of humans became evident.


What Does A Field Biologist Do?

Apart from conducting research, field biologists are expected to have expertise in understanding the ecologia and diversity, and the evolution of various organisms. In addition to that, they are also to understand how each organism play its niche (specific role) in the community.

Listed below are some of the most common duties of a field biologist.

1. Identification & Classification

Like any other biologists, field biologists are tasked to have expertise on taxonomy (science of identifying, naming, describing, and classifying organisms) as this skill will be helpful for them when on field.

2. Observe Behavioral Patterns

Of course, when on field, it will be necessary to take note of the organism’s unique behavior and ways of adaptation to their natural habitat.
  • Sometimes, field biologists even make traps or tranquilize wild animais in order to have information regarding their measurements, gender, age, and overall well-being.
  • After that, they put “Tag” or “locators” to these animals and free them eventually.
  • However, whenever their captured animal is an endangered one, field biologists transport them and bring to wildlife sanctuaries in order to try to save them.

3. Collect Samples

As a biologist, collecting samples is important to have a 360 degree view of the organism. Para plantas, the whole plant body is collected whereas for animals, blood, fecal remains (dung) and other substances produced by animals are necessary.

4. Act As An Environmental Advocate

It is important to note that a field biologist’s job is not only limited to research but also making the knowledge be known by everyone.
  • By being knowledgeable about the identity of various organisms, field biologists are tasked with influencing the general public in terms of the physical, economic, cultural, and health impacts of environmental issued.

5. Review Scientific Literature

This duty is common in the scientific field as the knowledge and discoveries needed to be reviewed and challenged for validity.
  • In field biology alone, the development of biological knowledge about the living processes are significant in developing ways to sustain the environment.

Want to have a sneak peak of what consists a field biologist’s adventures are? Follow this link and watch (the trailer) about how high school graduate Tyler Christensen tried to indulge himself in field biology.

Meanwhile, you can have the full view of the movie by following this link.


The need to identify which plant is which has existed for time immemorial. The ability depends to a large extent on what criteria and whose system is used. Determination now relies on modern taxonomy to define the identify of organisms. Taxonomy is the branch of biology which deals with identity, nomenclature and classification. The term was first coined in 1813 by Swiss botanist Augustin Pyramus de Candolle. Carl Linnaeus, who began modern taxonomy, used the term 'systematics' himself.

Determination then requires comparisons of certain characteristics and then assigning a particular specimen to a known taxonomic group, hopefully ultimately arriving at a species or infraspecific name. The characteristics used are usually morphological, such as colours, numbers, shapes and sizes of particular organs. Where possible, this is traditionally done using dichotomous keys. Keys are traditionally found in such works such as floras, field guides or monographs. Botanical or entomological keys have been coded as computer programs. Applications are even available now which use artificial intelligence to identify plants on the basis of photographs. There are not always keys available for certain regions or plant groups, and the person determining the specimen will then have to rely on characteristics in the species description or discovered through comparison of multiple specimens with the type. Using DNA barcoding is a modern method that does not require the determiner to be highly trained. Another similar method uses the alkaloid profiles of specimens to determine the species. The total weight or length of the genome as measured in base-pairs can be used to identify species. Paleontologists must be able to identify their specimens based only on the shapes and sizes of fossilised bones. In forestry, especially in the tropics, identifying trees based on the flowers or leaves high up in the crown can be difficult, a method of identifying tree species in this case is called a 'slash', a shallow machete cut to the trunk to expose the colours of the different layers inside, and show the type of sap. The science of identifying plant species using their pollen is called palynology. Geography can also sometimes help in narrowing down the identity of a specimen. Sometimes the determiner will be unable to identify a specimen clearly, and use such additions as cf. ou aff. to convey this.

Automated species identification uses artificial intelligence to identify species based on the images of the species. Projects like iNaturalist and [email protected] relies on crowdsourced data and assists identification through automatic as well as community input.